Het CIZ is een zelfstandig bestuursorgaan dat onder de verantwoordelijkheid van het ministerie van Volksgezondheid, Welzijn en Sport valt. Het CIZ speelt een belangrijke rol bij de uitvoering van de Wzd, onder meer ten aanzien van artikel 21 Wzd (het besluit tot opname en verblijf) en artikel 24 Wzd (de rechterlijke machtiging).